员工非正常离职公司怎么处理

员工非正常离职，公司可按规章制度处理，保障自身权益同时避免劳动纠纷。
1.解除劳动合同：若员工旷工等行为构成严重违纪，公司依据规章制度解除合同，并送达解除通知。
2.结算工资：按实际工作天数支付工资，如员工造成经济损失，可从工资扣除赔偿，但每月扣除不超当月工资20%，且扣除后剩余工资不低于当地月最低工资标准。
3.防止商业秘密泄露：员工掌握公司商业秘密，公司应立即采取措施，如收回资料、变更访问权限等。
4.办理转移手续：及时办理档案和社保关系转移手续，规避劳动纠纷。
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法律分析：
（1）公司以员工严重违纪解除劳动合同，需确保自身规章制度合法合规且经过民主程序制定并公示，解除通知的送达要符合法定或约定方式，这样解除行为才具合法性。
（2）结算工资时按实际工作天数支付是法定要求，扣除经济损失赔偿需有证据证明损失存在，且严格遵循扣除比例和剩余工资底线的规定，否则可能构成克扣工资。
（3）对于掌握商业秘密的员工，公司及时采取措施防止秘密泄露是保护自身合法权益的必要手段，若因未及时处理导致商业秘密泄露，可能面临损失无法挽回的风险。
（4）办理档案和社保关系转移手续是公司的法定义务，不及时办理可能引发劳动纠纷，公司需承担相应法律责任。

提醒：公司处理员工非正常离职时，要确保规章制度合法有效、操作流程合规，涉及经济赔偿要有充分证据，遇到复杂情况建议咨询专业意见。
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（一）明确员工旷工等行为构成严重违纪时，公司按照既定规章制度解除劳动合同，并及时将解除通知传达给员工。
（二）结算员工工资以实际工作天数为准，若员工行为给公司带来经济损失，公司可从工资中扣除赔偿费用，但每月扣除额度不能超过员工当月工资的20%，同时扣除后剩余工资需高于当地月最低工资标准。
（三）对于掌握公司商业秘密的员工，公司要马上采取诸如收回相关资料、变更访问权限等措施，防止商业秘密外泄。
（四）及时办理员工档案和社保关系转移手续，规避劳动纠纷。

法律依据：
《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条规定，劳动者严重违反用人单位的规章制度的，用人单位可以解除劳动合同。
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员工非正常离职，公司可如此处理：
若员工旷工等严重违纪，按公司制度解除劳动合同，并送达解除通知。

结算工资按实际工作天数支付，若有经济损失可扣除赔偿，但每月不超工资20%，且剩余工资不低于当地月最低工资。

员工掌握商业秘密，立即采取措施防泄密，如收回资料、变更权限。

办理档案和社保关系转移，规避劳动纠纷。
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结论：
员工非正常离职，公司可依规解除合同、结算工资、防泄密并办理档案社保转移。
法律解析：
根据《中华人民共和国劳动合同法》，员工旷工等严重违纪，公司有权解除劳动合同并送达通知。工资结算方面，按实际工作天数支付工资合理合法，而对于员工给公司造成的经济损失，公司可依法从工资扣除赔偿，但要遵循每月扣除不超当月工资20%且剩余工资不低于当地月最低工资标准的规定。若员工掌握商业秘密，公司采取收回资料、变更权限等措施，是为保护自身的商业秘密权。办理档案和社保关系转移手续，是公司应尽的义务，能避免后续劳动纠纷。若公司在处理员工非正常离职过程中遇到复杂问题，建议向专业法律人士咨询，以确保处理方式合法合规。